Methanethiol chủ yếu được sử dụng để sản xuất methionine, được sử dụng như một thành phần dinh dưỡng trong gia cầm và thức ăn chăn nuôi. Methanethiol cũng được sử dụng trong ngành công nghiệp nhựa như một chất điều tiết cho phản ứng trùng hợp gốc tự do và là tiền chất trong sản xuất thuốc trừ sâu.

Mercaptan cũng được sử dụng trong ngành công nghiệp khí tự nhiên như một chất tạo mùi, do khả năng tương thích lý tưởng với khí mê-tan. Mùi "trứng thối" đặc trưng của nó được khách hàng sử dụng khí tự nhiên biết đến rộng rãi như là một dấu hiệu cho thấy có thể rò rỉ khí, thậm chí chỉ một phút.[9]